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Candies

Candies Biotech · Synthetic Biology

AI 代谢设计基因回路编程人工细胞构建自主进化工厂

Candies 合成生物学

可编程生命工程

Candies 合成生物学以工程化范式重新定义生命——从代谢通路的理性设计到人工细胞的从零构建,合成生物学正在将生物制造从经验试错推进到可编程、可预测、可自主进化的工程时代。

合成生物学

核心指标

  • 12000
    +

    可编程代谢通路

  • 1800

    生物基产品

  • 250000
    +

    基因回路元件

  • 10000

    自主进化周期

Core technologies

核心能力矩阵

从基因编辑到生物制药,全栈生物技术能力覆盖基础研究到产业落地。

  • BioComposer — AI 代谢通路设计引擎

    自然语言输入目标分子,AI 引擎自动设计最优代谢通路——预测热力学可行性、辅因子平衡、毒性中间体规避,并生成可执行的 DNA 构建方案。

  • CircuitLab — 可编程基因回路

    标准化基因逻辑元件库——25 万+ 经过验证的启动子、核糖体结合位点、终止子和调控蛋白,支持复杂逻辑回路的模块化组装。

  • CellFree Pro — 无细胞快速原型

    体外重构转录-翻译系统,从 DNA 到功能蛋白仅需 2 小时。用于毒性产物合成、快速通路验证和现场诊断试剂生产。

Architecture

BioForge 自主进化架构

BioForge 架构

五层架构——从分子设计到自主进化,构建 AI 驱动的可编程生物制造平台,实现从通路设计到工业化生产的全链路自动化。

  • AI 设计层

    大语言模型 + 物理模拟引擎,从分子功能描述自动生成代谢通路设计方案

  • DNA 合成层

    高通量 DNA 打印工厂,日产 100 Mb 级合成 DNA,错误率 <10⁻⁸

  • 自主进化层

    连续培养 + 自适应突变筛选,菌株在 10000 代内自主优化至理论最优

  • 智能工厂层

    全自动化发酵-分离-纯化产线,数字孪生实时优化生产参数

  • 生态安全层

    多层生物遏制——营养缺陷型 + 非标准密码子 + 环境感应自杀开关

Roadmap

研发路线图

从基础研究到临床转化的关键里程碑与项目节点。

  1. Phase I已完成

    BioComposer — AI 代谢通路设计平台

    发布 BioComposer 1.0,支持 12000+ 化合物的代谢通路自动设计,平均设计到 DNA 构建 72 小时。

    BioComposer 平台
  2. Phase II进行中

    自主进化细胞工厂

    建成自主进化引擎,工程菌在 10000 代连续培养中自主优化至理论最优产量,首批 20 种高价值化合物进入工业化生产。

    自主进化工厂
  3. Phase III规划中

    人工最小细胞 SynCell-500

    构建 500 基因组的人工最小细胞,具备自主代谢、自我复制和可编程功能,开启从零设计生命体的新纪元。

    SynCell-500

Use cases

应用场景

从实验室研究到产业落地,覆盖生物科技全应用域。

生物制造

  • 碳负性材料

    以 CO₂ 和废弃物为原料,工程微生物合成高性能可降解材料,生产过程净碳固定

  • 天然产物全合成

    AI 设计代谢通路,一步发酵生产紫杉醇、长春花碱等高价值天然药物

  • 生物航空燃料

    工程化蓝藻直接光合合成航空级碳氢燃料,能量转化效率突破 12%

活体治疗

  • 智能活体药物

    搭载基因回路的工程菌在体内自主诊断、感知、响应、治疗,按需释放治疗载荷

  • 体内细胞工厂

    植入式工程化细胞在体内持续生产治疗性蛋白,替代频繁注射给药

环境修复

  • 超级降解菌

    自主进化工程菌降解 PFAS、微塑料等持久性有机污染物,降解率 >99%

  • 人工光合系统

    全人工光合膜将太阳能转化为化学能,效率是天然光合作用的 5 倍

Case studies

案例研究

从实验室到临床、从研发到产业的真实案例前后对比。

  • AI 设计抗癌药物合成

    制药

    AI 设计抗癌天然产物全合成

    BioComposer 引擎设计紫杉醇全合成代谢通路,在工程化酵母中实现从葡萄糖到紫杉醇的一步发酵生产,年产能达 50 吨,彻底摆脱红豆杉资源依赖。

    改进前

    依赖珍稀植物提取,供应受限、成本高昂

    改进后

    发酵法一步生产,成本降低 95%

    • 成本降低 95%
    • 年产能 50吨
  • 碳负性生物塑料

    材料

    自主进化工程菌生产碳负性塑料

    自主进化引擎驱动的工程菌株以工业废气 CO₂ 为碳源,直接合成高性能生物可降解聚合物。生产过程实现碳负性,每吨产品净固定 1.8 吨 CO₂。

    改进前

    石油基塑料,碳排放高,白色污染

    改进后

    CO₂ 为原料,碳负性生产,180 天完全降解

    • 碳固定 1.8吨/吨产品
    • 降解周期 180天
  • 活体智能药物

    医疗

    活体智能药物 — 肠道自主诊断治疗

    搭载基因回路的工程化益生菌在肠道内自主感知炎症标志物,按需释放抗炎因子和组织修复肽。II 期试验显示克罗恩病内镜缓解率 82%。

    改进前

    全身免疫抑制,副作用严重,需终身用药

    改进后

    肠道自主感知-响应-治疗,内镜缓解率 82%

    • 内镜缓解率 82%
    • 副作用 降低 95%

Synthetic Biology

生物回路与细胞工厂

基因回路设计、代谢通路工程、无细胞合成系统与底盘细胞构建等技术模块说明。

  • AI 驱动代谢通路设计

    核心

    BioComposer 大语言模型结合热力学数据库和酶动力学模型,从分子结构自动推导最优生物合成路径,预测准确率达 96.4%。

    • 逆合成推理

      从目标分子逆向推导所有可能的生物合成路径,AI 排序最优方案

    • 辅因子平衡

      自动优化 NAD(P)H/ATP/CoA 等辅因子的供给与消耗平衡

    • 毒性规避

      预测中间体毒性,自动设计旁路或区室化策略

    AI 代谢通路设计
  • 自主进化引擎

    前沿

    连续培养系统中,工程化微生物在 10000+ 代的自适应进化中自主优化目标性状——无需人工干预,AI 仅需定义选择压力。

    • 定向选择压力

      AI 设计连续变化的选择压力梯度,引导进化方向

    • 高通量基因型-表型映射

      每 100 代全基因组测序,追踪有利突变的固定过程

    • 多目标并行进化

      同一培养体系中同时优化产量、耐受性和底物利用效率

    自主进化引擎

FAQ

常见问题

技术原理、应用边界与工程现状说明。

通用

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